昔、東京都に存在した区。1947年に小石川区と本郷区が合併し文京区が誕生。 語源は小石の多い川という由来が有力。
「さよなら絶望先生」の主な舞台となっている。 小石川区が登場するのは、講談社が音羽にあることによる。
また、夏目漱石の小説作品「こころ」の舞台でもある。